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Contact : Benoît Bordignon

Projet : cofinancé au titre du Programme Opérationnel FEDER-FSE 2014-2020 Languedoc Roussillon
 

PERSONNEL

Benoît Bordignon

Responsable technique
Criblage /
Développement

Cédric Hassen-Khodja

Bio-informaticien
Statistiques /
Analyses d'images

Frédéric Lionneton

Responsable de la
plateforme MGC


Equipements

Robot de pipettage:

Lecteur de plaques :

Equipé pour la fluorescence, luminescence et HTRF.

 

Automate :

Distributeur rapide de liquide, utilisé pour l'ensemencement des cellules (sous PSM).

 

Distributeur manuel :

Distributeur manuel de liquide (10 - 100 µL) à tête 96 canaux.

 

SpeedVac pour plaques multipuits :

Sécheur de plaques pour 2 plaques.


Nos prestations

Le service de criblage permet la réalisation de cribles in vitro ou in vivo pour des modèles compatibles avec les plaques 96/384 puits. Notre équipement robotique permet la réalisation de tâches répétitives de façon reproductible et robuste, tout projet nécessitant une automatisation peut bénéficier d'une robotisation de toutes ou de certaines de ses étapes. Nous pouvons réaliser des criblages de types « high-throughput screening » (HTS) ou « high-content screening » (HCS) en fonction des modèles, des cibles et des paramètres d’intérêts.

Nous proposons donc d’accompagner les porteurs de projets dans chaque étape de la réalisation d'un crible. Premièrement, nous aidons à l’optimisation d’un protocole de test fonctionnel au format plaque 96 puits adapté aux cibles identifiées. Deuxièmement, nous procédons au transfert du protocole manuel sur le robot (automatisation), nous réalisons une série de tests préliminaires avec des contrôles spécifiques (positifs et négatifs) pour évaluer la robustesse et reproductibilité du protocole automatisé. En parallèle, nous optimisons les méthodes d'acquisitions et d’analyses (lectures HTS ou images HCS) adaptées aux paramètres du crible. Enfin, nous réalisons le crible complet et procédons aux analyses statistiques des résultats permettant l'identification des « Hits ».

High-Throughput Screening (HTS)

Dans le cadre d’un crible de type HTS, nous utilisons la plateforme TECAN FreedomEVO 200. Elle comprend deux bras de pipetages de 8 et 96 canaux, d’un laveur de plaques 96/384 puits, d’un carrousel et d’un incubateur CO2 motorisés de grandes capacités, ainsi qu'un lecteur de microplaques multimodes compatible jusqu’au format 1536 puits. Cette plateforme permet la réalisation des cribles HTS entièrement automatisés, de la préparation des échantillons à la lecture finale des plaques, en passant par les différents traitements et incubations.

High Content Screening (HCS)

Fourchettes tarifaires indicatives (dégressif en fonction du volume) : 

- Criblage HTS banque de molécules type Prestwick 1280pts : 3000€ - 5000€
- Criblage HCS immunomarquage (IF) et Imagerie 1280pts : 4000€ - 7000€
- Criblage HCS banques siRNA 2300pts : 5000€
- Essais à faible débit type IC50 (5 molécules ; n=3) : 2000€ - 3000€


Nos banques

ORFEOMES via la plateforme MGC
sites web : https://www.biocampus.cnrs.fr/index.php/fr/plateforme-biocampus/plateformes-technologiques/195-mgc
https://www.igmm.cnrs.fr/service/collection-genomique-de-montpellier-mgc/

Banques siRNA Humains : Kinesins/Myosins/Dyneins; Membrane Trafficking; Rho GEFs
site web : https://horizondiscovery.com/products/screening/screening-libraries/Gene-modulation-screening-libraries/siRNA/human-sirna-libraries

Crispr Cas9 : Sanger Human whole genome Crispr libraries, lentiviral and glycerol stock
site web : https://www.sigmaaldrich.com/life-science/functional-genomics-and-rnai/sanger-crispr-arrayed-library.html

Banque chimique : Chimiothèque Nationale Essentielle (CNE : 1000 composés), une sous-chimiothèque représentative de la Chimiothèque Nationale, sur demande
sites web : http://chimiotheque-nationale.cn.cnrs.fr/?Presentation
https://chembiofrance.cn.cnrs.fr/fr/

Banque chimique : Anti-cancer Compound Library 4730 (composés) TargetMol
site web : https://www.targetmol.com/compound-library/anti_cancer_compound_library

Banque chimique : Prestwick Chemical Library, update 2019 (1520 composés)
site web : https://www.prestwickchemical.com/screening-libraries/prestwick-chemical-library/

Banque chimique : Lopac 1280 Pharmacologically Active Compounds Library
site web : https://www.sigmaaldrich.com/FR/fr/product/sigma/lo4200?context=product

                                             


Où nous trouver ?

CRBM UMR5237

Rez-de-chaussée porte 141,
1919 route de Mende
34293 Montpellier Cedex 05

Téléphone : +33 4 34 35 95 18

GPS : Latitude = 43.63767 ; Longitude = 3.86544